Cancro alla prostata: i big data sbloccano 80 nuovi bersagli farmacologici
Nel più grande studio per analizzare la genetica del cancro alla prostata, gli scienziati trovano non meno di 80 nuovi potenziali bersagli farmacologici. Il progetto apre ampie strade per la progettazione di nuovi trattamenti.
L'estrazione di dati genetici era, una volta, un compito ingombrante e incredibilmente dispendioso in termini di tempo.
Tuttavia, poiché la tecnologia continua a migliorare, il lavoro è diventato notevolmente più veloce ed economico.
Parallelamente, gli strumenti disponibili per la gestione di set di dati di grandi dimensioni sono notevolmente migliorati.
Nel complesso, ciò significa che gli oceani di informazioni raccolte dal codice genetico possono essere analizzati, mappati e combinati con relativa facilità per fornire un nuovo livello di chiarezza.
Recentemente, un team internazionale ha utilizzato questo duplice approccio di analisi del DNA e big data per approfondire la genetica del cancro alla prostata. A caccia di crepe molecolari nell'armatura della malattia, la ricerca è stata orchestrata dall'Institute of Cancer Research di Londra, Regno Unito.
Sfide contro il cancro alla prostata
Il cancro alla prostata è il secondo tumore più comune tra gli uomini negli Stati Uniti. Quest'anno, negli Stati Uniti, ci saranno circa 164.690 nuovi casi di cancro alla prostata e quasi 30.000 decessi per malattia.
Sebbene i ricercatori abbiano fatto progressi nella comprensione e nel trattamento del cancro alla prostata, ci sono ancora una serie di difficoltà.
Come spiega la professoressa Rosalind Eeles, leader dello studio, "Una delle sfide che dobbiamo affrontare nella ricerca sul cancro è la complessità della malattia e il gran numero di modi in cui potremmo potenzialmente trattarla".
La dottoressa Justine Alford, del Cancer Research U.K., delinea un altro problema nello studio e nell'intervento nel cancro alla prostata.
"Uno dei principali ostacoli per fare ulteriori progressi contro il cancro alla prostata", spiega, "è la mancanza di modi per prevedere con precisione come progredirà la malattia di una persona, rendendo difficile sapere quale trattamento è migliore per ogni paziente".
Raccolta di dati genetici
Per affrontare il problema da una nuova direzione, i ricercatori hanno preso informazioni genetiche da 112 uomini con cancro alla prostata e le hanno combinate con i dati di una serie di altri studi. In tutto, sono stati utilizzati campioni di 930 pazienti.
Utilizzando le più recenti tecniche di big data, il team ha raccolto nuove informazioni sui cambiamenti genetici che stimolano lo sviluppo e alimentano il progresso del cancro alla prostata. Una volta compresi i geni coinvolti, potrebbero creare una mappa delle proteine codificate da questi geni.
Successivamente, si sono rivolti a un database chiamato canSAR, che combina i dati di studi, applica l'apprendimento automatico e aiuta a fornire informazioni sulla scoperta di farmaci.
Sul loro sito web, canSAR spiega le domande a cui il suo database intende rispondere: “Cosa si sa di una proteina, in quale cancro è espressa o mutata, e quali strumenti chimici e modelli di linee cellulari possono essere utilizzati per sondare sperimentalmente la sua attività? Cosa si sa di un farmaco, il suo profilo di sensibilità cellulare e quali proteine si legano che possono spiegare una bioattività insolita? "
Gli scienziati hanno scoperto che 80 delle proteine che avevano scoperto erano potenziali bersagli farmacologici. E, 11 di questi sono stati presi di mira da farmaci esistenti e altri sette potrebbero essere presi di mira da farmaci già in sperimentazione clinica.
I loro risultati sono stati pubblicati questa settimana sulla rivista Nature Genetics.
"Il nostro studio ha applicato tecniche all'avanguardia nell'analisi dei big data per sbloccare una vasta gamma di nuove informazioni sul cancro alla prostata e sui possibili modi per combattere la malattia".
Prof. Rosalind Eeles
Guardando al futuro
Le scoperte richiederanno ulteriori studi prima di poter essere utilizzate clinicamente, ovviamente, ma forniscono una gamma di nuove possibilità.
Come spiega il coautore Prof. Paul Workman: “Questo studio ha scoperto un numero notevolmente elevato di nuovi geni che guidano lo sviluppo del cancro alla prostata e ci ha fornito informazioni vitali su come sfruttare la biologia della malattia per trovare potenziali nuovi trattamenti. "
Spera che il loro lavoro "stimolerà un'ondata di nuove ricerche sui cambiamenti genetici e sui potenziali bersagli farmacologici [che] hanno identificato, con l'obiettivo che i pazienti dovrebbero trarne beneficio il prima possibile".
Un altro ostacolo per la progettazione di trattamenti contro il cancro alla prostata è il modo in cui la malattia progredisce in modo diverso in ogni individuo. Ciò rende molto più difficile decidere quali opzioni di trattamento sono più adatte a ciascun paziente.
Il dottor Alford spera che "[b] y migliorando notevolmente la nostra comprensione della genetica alla base della malattia, [...] in futuro, questa conoscenza potrebbe aiutare i medici ad adattare meglio i trattamenti al cancro di un individuo e, si spera, vedere più persone sopravvivere alla loro malattia. "
Questi sono i primi giorni, ma i risultati che arriveranno dalla prossima generazione di studi potrebbero essere trasformativi per il campo.
