I ricercatori scoprono quasi 2.000 nuovi batteri intestinali
Secondo numerosi studi recenti, le popolazioni batteriche intestinali umane sono in grado di influenzare vari aspetti della nostra salute fisica e mentale. Nonostante ciò, molti batteri rimangono "non mappati" dagli scienziati. Un nuovo studio ha ora scoperto circa 2.000 batteri intestinali precedentemente sconosciuti.
Studi recenti coperti da Notizie mediche oggi hanno dimostrato che il microbiota intestinale potrebbe avere un ruolo nella malattia di Parkinson e nella demenza e potrebbero spiegare perché i farmaci per il diabete di tipo 2 funzionano bene per alcuni ma non per altri.
Nuova ricerca - apparsa ieri sulla rivista Natura - ha ora identificato quasi 2.000 nuove specie batteriche intestinali che gli scienziati non hanno mai coltivato in un laboratorio prima.
Il team di ricercatori, dell'Istituto europeo di bioinformatica (EMBL-EBI) e dell'Istituto Wellcome Sanger, entrambi a Hinxton, Regno Unito, ha utilizzato l'analisi computazionale per valutare i campioni di microbioma intestinale dei partecipanti in tutto il mondo.
"I metodi computazionali ci consentono di comprendere i batteri che non possiamo ancora coltivare in laboratorio", spiega l'autore dello studio Rob Finn, dell'EMBL-EMI.
"Usare la metagenomica [l'analisi del materiale genetico] per ricostruire i genomi batterici è un po 'come ricostruire centinaia di puzzle dopo aver mescolato tutti i pezzi insieme, senza sapere come dovrebbe essere l'immagine finale e dopo aver rimosso completamente alcuni pezzi dal mescolare solo per renderlo un po 'più difficile ", continua.
Tuttavia, Finn prosegue osservando: "I ricercatori sono ora in una fase in cui possono utilizzare una gamma di strumenti computazionali per integrare e talvolta guidare il lavoro di laboratorio, al fine di scoprire nuove intuizioni nell'intestino umano".
Un nuovo approccio
Il team è stato in grado di ricostruire 92.143 genomi da campioni di 11.850 diversi microbiota intestinali.
Ciò ha permesso ai ricercatori di identificare 1.952 specie di batteri intestinali di cui loro e altri non erano a conoscenza fino a quel momento.
Finn e colleghi spiegano che molte specie batteriche hanno "mantenuto un profilo basso", per così dire, perché gli scienziati le hanno trovate solo in numero molto basso nell'intestino, o non possono sopravvivere al di fuori dell'ambiente intestinale.
Questo, notano, ha finora impedito agli scienziati di aggiungere tali specie alla loro lista di batteri intestinali di cui sono a conoscenza. Questo è anche il motivo per cui il team che ha condotto l'attuale studio ha deciso di prendere una nuova strada e di utilizzare una combinazione di metodi computazionali per cercare di trovare una "mappa" più completa del microbiota umano.
"I metodi computazionali ci consentono di avere un'idea delle molte specie batteriche che vivono nell'intestino umano, come si sono evolute e che tipo di ruoli possono svolgere all'interno della loro comunità microbica", afferma il coautore dello studio Alexandre Almeida.
Verso la creazione di "un solido progetto"
"In questo studio", spiega Almeida, "abbiamo sfruttato i database pubblici più completi di batteri gastrointestinali per identificare specie batteriche che non sono state viste prima. I metodi di analisi che abbiamo utilizzato sono altamente riproducibili e possono essere applicati a set di dati più ampi e diversificati in futuro, consentendo ulteriori scoperte ".
In futuro, i ricercatori sperano che questo e altri studi simili aiuteranno ulteriormente la loro comprensione dell'intestino umano, il che, a sua volta, contribuirà allo sviluppo di trattamenti migliori per una varietà di condizioni.
"Ricerche come questa ci stanno aiutando a creare un cosiddetto modello dell'intestino umano, che, in futuro, potrebbe aiutarci a comprendere meglio la salute e le malattie umane e potrebbe persino guidare la diagnosi e il trattamento delle malattie gastrointestinali".
Coautore dello studio Trevor Lawley, del Wellcome Sanger Institute
Allo stesso tempo, il team osserva che il presente studio ha reso i ricercatori più consapevoli di una grande lacuna nella ricerca sui batteri intestinali.
Gli scienziati attualmente sanno relativamente poco sulle specie batteriche che sono caratteristiche di popolazioni diverse da quelle che abitano l'Europa e il Nord America, sottolineano i ricercatori.
“Stiamo vedendo molte delle stesse specie batteriche affiorare nei dati delle popolazioni europee e nordamericane. Tuttavia, i pochi set di dati sudamericani e africani a cui abbiamo avuto accesso per questo studio hanno rivelato una diversità significativa non presente nelle popolazioni precedenti ", osserva Finn.
"Ciò suggerisce che la raccolta di dati da popolazioni sottorappresentate è essenziale se vogliamo ottenere un quadro veramente completo della composizione dell'intestino umano", aggiunge, esortando i ricercatori a continuare a concentrarsi su coorti più diversificate, andando avanti.
